Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim55G3X8Y1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim55G3X8Y1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms