Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccl26F8VQM2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccl26F8VQM2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccl26F8VQM2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccl26F8VQM2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms