Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srp72F8VQC1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srp72F8VQC1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms