Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28038F7BCN9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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