Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
3110082J24RikF6Z6Z2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
3110082J24RikF6Z6Z2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms