Protein–RNA interactions for Protein: F6V035

Ccdc149, Coiled-coil domain-containing 149, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc149F6V035 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc149F6V035 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc149F6V035 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms