Protein–RNA interactions for Protein: F6R5P4

Ccl17, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl17F6R5P4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl17F6R5P4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl17F6R5P4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms