Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc74aE9Q9U8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc74aE9Q9U8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc74aE9Q9U8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc74aE9Q9U8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc74aE9Q9U8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc74aE9Q9U8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc74aE9Q9U8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc74aE9Q9U8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc74aE9Q9U8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc74aE9Q9U8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc74aE9Q9U8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.8 ms