Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp17lbE9Q9U0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp17lbE9Q9U0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp17lbE9Q9U0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms