Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TrdnE9Q9K5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TrdnE9Q9K5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms