Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FancfE9Q5Z5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancfE9Q5Z5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancfE9Q5Z5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancfE9Q5Z5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancfE9Q5Z5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancfE9Q5Z5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancfE9Q5Z5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FancfE9Q5Z5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141 ms