Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcdhb9E9Q5G2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pcdhb9E9Q5G2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcdhb9E9Q5G2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcdhb9E9Q5G2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms