Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
BC005561E9Q5E2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
BC005561E9Q5E2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
BC005561E9Q5E2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
BC005561E9Q5E2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
BC005561E9Q5E2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
BC005561E9Q5E2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
BC005561E9Q5E2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BC005561E9Q5E2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BC005561E9Q5E2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
BC005561E9Q5E2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BC005561E9Q5E2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BC005561E9Q5E2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BC005561E9Q5E2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
BC005561E9Q5E2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BC005561E9Q5E2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BC005561E9Q5E2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BC005561E9Q5E2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
BC005561E9Q5E2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BC005561E9Q5E2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
BC005561E9Q5E2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
BC005561E9Q5E2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
BC005561E9Q5E2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
BC005561E9Q5E2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
BC005561E9Q5E2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
BC005561E9Q5E2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.4 ms