Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApobE9Q414 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ApobE9Q414 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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