Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpfE9Q3P4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpfE9Q3P4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpfE9Q3P4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms