Protein–RNA interactions for Protein: E9Q355

Catsperg1, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg1E9Q355 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Catsperg1E9Q355 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Catsperg1E9Q355 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Catsperg1E9Q355 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms