Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NebE9Q1W3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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