Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
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Ccdc171E9Q1U1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc171E9Q1U1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
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Ccdc171E9Q1U1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
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Ccdc171E9Q1U1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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Ccdc171E9Q1U1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
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Ccdc171E9Q1U1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc171E9Q1U1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
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Ccdc171E9Q1U1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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Ccdc171E9Q1U1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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Ccdc171E9Q1U1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc171E9Q1U1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
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