Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Zfp558E9Q1J0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Zfp558E9Q1J0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Zfp558E9Q1J0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp558E9Q1J0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp558E9Q1J0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Zfp558E9Q1J0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Zfp558E9Q1J0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Zfp558E9Q1J0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp558E9Q1J0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp558E9Q1J0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp558E9Q1J0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp558E9Q1J0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Zfp558E9Q1J0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp558E9Q1J0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Zfp558E9Q1J0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp558E9Q1J0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Zfp558E9Q1J0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Zfp558E9Q1J0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp558E9Q1J0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Zfp558E9Q1J0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Zfp558E9Q1J0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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Zfp558E9Q1J0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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