Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm3893E9Q1I1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm3893E9Q1I1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
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