Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Myo5cE9Q1F5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Myo5cE9Q1F5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Myo5cE9Q1F5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Myo5cE9Q1F5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Myo5cE9Q1F5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
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