Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdr1E9Q0B4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdr1E9Q0B4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdr1E9Q0B4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdr1E9Q0B4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms