Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B3

Uncharacterized membrane protein C3orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9Q0B3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9Q0B3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E9Q0B3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9Q0B3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9Q0B3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
E9Q0B3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9Q0B3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9Q0B3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9Q0B3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9Q0B3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E9Q0B3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9Q0B3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9Q0B3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms