Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm9972E9Q053 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm9972E9Q053 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm9972E9Q053 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm9972E9Q053 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm9972E9Q053 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm9972E9Q053 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm9972E9Q053 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm9972E9Q053 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm9972E9Q053 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm9972E9Q053 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm9972E9Q053 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm9972E9Q053 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms