Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim30dE9PWL0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Trim30dE9PWL0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim30dE9PWL0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms