Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FgaE9PV24 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FgaE9PV24 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FgaE9PV24 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FgaE9PV24 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FgaE9PV24 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FgaE9PV24 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FgaE9PV24 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FgaE9PV24 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FgaE9PV24 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FgaE9PV24 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FgaE9PV24 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FgaE9PV24 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FgaE9PV24 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FgaE9PV24 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FgaE9PV24 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FgaE9PV24 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms