Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Cngb1E1AZ71 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Cngb1E1AZ71 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Cngb1E1AZ71 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
Cngb1E1AZ71 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Cngb1E1AZ71 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Cngb1E1AZ71 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Cngb1E1AZ71 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Cngb1E1AZ71 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms