Protein–RNA interactions for Protein: D3Z642

4930595D18Rik, RIKEN cDNA 4930595D18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595D18RikD3Z642 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930595D18RikD3Z642 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930595D18RikD3Z642 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930595D18RikD3Z642 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms