Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim12cD3Z3L3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim12cD3Z3L3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim12cD3Z3L3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim12cD3Z3L3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim12cD3Z3L3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim12cD3Z3L3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim12cD3Z3L3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim12cD3Z3L3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim12cD3Z3L3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim12cD3Z3L3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms