Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccnb1ip1D3Z3K2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms