Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
3425401B19RikD3Z1D3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
3425401B19RikD3Z1D3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms