Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200bD3Z0P8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem200bD3Z0P8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms