Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc6D3YZP9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc6D3YZP9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms