Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ldlrad1D3YYZ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ldlrad1D3YYZ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ldlrad1D3YYZ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms