Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonrf1D3YY23 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lonrf1D3YY23 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms