Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc170D3YXL0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc170D3YXL0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc170D3YXL0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms