Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC048679D3YXE9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC048679D3YXE9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC048679D3YXE9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC048679D3YXE9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC048679D3YXE9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC048679D3YXE9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC048679D3YXE9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC048679D3YXE9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC048679D3YXE9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC048679D3YXE9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BC048679D3YXE9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BC048679D3YXE9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BC048679D3YXE9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms