Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga9B8JK39 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga9B8JK39 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms