Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syce3B5KM66 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Syce3B5KM66 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syce3B5KM66 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms