Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnldc1B2RXZ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms