Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hbb-bh2B2RVB7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hbb-bh2B2RVB7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms