Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scml2B1AVB3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scml2B1AVB3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scml2B1AVB3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scml2B1AVB3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scml2B1AVB3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scml2B1AVB3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scml2B1AVB3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scml2B1AVB3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scml2B1AVB3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scml2B1AVB3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms