Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Grik3B1AS29 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grik3B1AS29 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms