Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn8B1ARD8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn8B1ARD8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms