Protein–RNA interactions for Protein: A9Z055

H2al2b, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al2bA9Z055 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al2bA9Z055 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al2bA9Z055 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms