Protein–RNA interactions for Protein: A9YVJ5

Gbp11, Guanylate binding protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp11A9YVJ5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp11A9YVJ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp11A9YVJ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp11A9YVJ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms