Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms