Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubb1A2AQ07 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb1A2AQ07 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb1A2AQ07 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms