Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Frmpd1A2AKB4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Frmpd1A2AKB4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Frmpd1A2AKB4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Frmpd1A2AKB4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Frmpd1A2AKB4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Frmpd1A2AKB4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Frmpd1A2AKB4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Frmpd1A2AKB4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Frmpd1A2AKB4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Frmpd1A2AKB4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Frmpd1A2AKB4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Frmpd1A2AKB4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Frmpd1A2AKB4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Frmpd1A2AKB4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
Frmpd1A2AKB4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Frmpd1A2AKB4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Frmpd1A2AKB4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Frmpd1A2AKB4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Frmpd1A2AKB4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Frmpd1A2AKB4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Frmpd1A2AKB4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Frmpd1A2AKB4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Frmpd1A2AKB4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Frmpd1A2AKB4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Frmpd1A2AKB4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Frmpd1A2AKB4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
Frmpd1A2AKB4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Frmpd1A2AKB4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Frmpd1A2AKB4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Frmpd1A2AKB4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Frmpd1A2AKB4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Frmpd1A2AKB4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Frmpd1A2AKB4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Frmpd1A2AKB4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Frmpd1A2AKB4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Frmpd1A2AKB4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Frmpd1A2AKB4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
Frmpd1A2AKB4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Frmpd1A2AKB4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Frmpd1A2AKB4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Frmpd1A2AKB4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Frmpd1A2AKB4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Frmpd1A2AKB4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Frmpd1A2AKB4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Frmpd1A2AKB4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Frmpd1A2AKB4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Frmpd1A2AKB4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Frmpd1A2AKB4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Frmpd1A2AKB4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Frmpd1A2AKB4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Frmpd1A2AKB4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Frmpd1A2AKB4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Frmpd1A2AKB4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Frmpd1A2AKB4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Frmpd1A2AKB4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Frmpd1A2AKB4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Frmpd1A2AKB4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Frmpd1A2AKB4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Frmpd1A2AKB4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Frmpd1A2AKB4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Frmpd1A2AKB4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms