Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lcn6A2AJB9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lcn6A2AJB9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Lcn6A2AJB9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lcn6A2AJB9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lcn6A2AJB9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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